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厭氧菌是指無氧或氧化還原電勢低的條件下才能生長繁殖的一類細菌。根據對氧的敏感程度，廣義的厭氧菌可分為專性厭氧菌、微需氧菌和耐氧菌。習慣上厭氧菌是指專性厭氧菌，即必須在大幅度降低氧分壓的條件下才能生長，可分為兼性厭氧菌、微需氧菌和專性厭氧菌。臨床上所謂的厭氧菌肺炎主要指專性厭氧菌所致的肺部感染。專性厭氧菌只能在無氧或低于正常大氣氧分壓的條件下才能生存或生長，進一步可分為極端厭氧菌、中度厭氧菌和耐氧厭氧菌。
一、極端厭氧菌
這類厭氧菌對氧極端敏感，在0.5%的氧濃度下，或在空氣中暴露不到10min即死亡。因在臨床實驗室極難分離到，目前尚不知其致病情況。
二、中度厭氧菌
這類厭氧菌能在2%～8%氧濃度中生長，在空氣中暴露60～90min還能夠分離出來。導致肺部感染的常見厭氧菌，如脆弱擬桿菌、產氣莢膜梭菌等均屬此類，為臨床最常見的一類厭氧菌。
三、耐氧厭氧菌
這類厭氧菌在無氧件下生長最好，而在有氧條件下生長較差。第2梭菌和溶組織梭菌即屬此類。其中肺部感染的常見厭氧菌有：
(1)革蘭陰性厭氧桿菌：
為肺部厭氧菌感染的常見菌。文獻報道在吸入性肺炎、壞死性肺炎、肺膿腫和膿胸，分離到革蘭陰性厭氧桿菌分別約占53.67%，56.45%，50.87%和39.29%，其中擬桿菌屬占第1位，其次為梭桿菌屬。
①擬桿菌屬：
為革蘭陰性無芽孢桿菌。少數菌株有莢膜或鞭毛。專性厭氧。能利用糖和蛋白質的中間代謝產物。模式菌為脆弱擬桿菌。菌體形態為短桿狀，染色不勻，中間染色淺或不著色，使菌體呈空泡狀。兩端圓而濃染。在固體培養基上不規則，表現長短不一。在培養條件稍有改變，如厭氧條件不足、營養不良或酸性產物堆積時，菌體出現多形態性。引起肺部感染的擬桿菌以脆弱擬桿菌和產黑色素擬桿菌最多見。
②梭桿菌屬：
可能為革蘭陰性無芽孢桿菌，專性厭氧，無鞭毛，能利用糖和蛋白胨。模式菌種為核梭桿菌，該菌中間膨大，兩端尖，菌體內有革蘭陽性顆粒，長短不等，形態較規則。菌體呈雙，尖端對尖端。引起肺部感染的梭桿菌屬以核梭桿菌和壞死梭桿菌多見。
(2)革蘭陽性厭氧球菌：
革蘭陽性厭氧球菌在肺部感染中僅次于革蘭陰性厭氧桿菌。文獻報道在上述肺部感染中均約占1/4～1/3，其中以消化鏈球菌屬和消化球菌屬為常見。
①消化鏈球菌屬：
消化鏈球菌菌體較小，直徑0.5～0.6μm，排列成雙或成鏈，形成針尖大小直徑1mm的圓形、光滑、凸起、灰白色、不透明、不溶血的菌落，為肺部感染最常見的革蘭陽性厭氧球菌。
②消化球菌屬：
消化球菌的菌體圓形，直徑0.3～1.3μm，排列成雙、短鏈或成堆。生長緩慢，培養2～4天形成小菌落，為肺部厭氧菌感染較常見的細菌。
(3)革蘭陰性厭氧球菌：
革蘭陰性厭氧球菌中的韋榮球菌，也是肺部厭氧菌感染的病原菌，在肺部厭氧菌感染中約占3.7%。該菌菌體較小，0.3～0.6μm直徑，有時成短鏈，在培養初期為革蘭陽性，過夜即變為革蘭陰性。
(4)革蘭陽性厭氧桿菌：
革蘭陽性厭氧桿菌約占肺部感染厭氧菌的1/5，其中真桿菌屬、丙酸桿菌屬和梭菌屬最為常見。
①真桿菌屬：
真桿菌屬為革蘭陽性無芽孢桿菌，形態規則，菌體大小為(0.6～1)μm×(2～4)μm。常排列成單、雙、短鏈，革蘭染色陽性菌落小圓而扁，半透明，灰色，不溶血。模式菌為黏性真桿菌。約占肺部革蘭陽性桿菌感染的1/4。
②丙酸桿菌屬：
為革蘭陽性無芽孢多形性桿菌。直或微彎，呈棒狀，大小為(0.5～0.8)μm×(1～5)μm，染色不均。排列呈X、Y、V及柵狀。無莢膜，無鞭毛．菌落小，圓形，灰白或其他顏色，不透明。模式菌為弗勞地丙酸桿菌。亦為肺部感染的常見菌。
③梭菌屬：
菌體中部膨大呈梭形，模式菌為酪酸梭菌。菌體形態直或微彎，長短或寬度不變，兩端尖或圓，排列呈單、雙、短鏈或多樣。高齡是發病的重要因素，常有口腔衛生不良、牙周炎、顱腦損傷、腦血管疾病、癲癇、酗酒、全身麻醉等誘因病史。另外，支氣管狹窄、支氣管新生物、阻塞性肺炎、支氣管擴張、肺栓塞等基礎疾病也易引發厭氧菌感染。
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